Daarnaast is Bureau Jeugdzorg verantwoordelijk voor de kinderbescherming. Het AMK (Algemeen Meldpunt Kindermishandeling) valt ook onder het Bureau Jeugdzorg. Medewerkers van Bureau Jeugdzorg werken ook als adviseurs binnen de (toekomstige) Centra voor Jeugd en Gezin. Hiermee houdt het Bureau Jeugdzorg overzicht over alle instellingen en personen die zich beroepsmatig met de (verstoorde) ontwikkeling van minderjarige kinderen bezighouden.